一九九八年江泽民主席访问日本，中日双方本着“以史为鉴，面向未来”的精神认真总结了两国关系发展的经验教训，一致同意建立中日两国“致力于和平与发展的友好合作伙伴关系”，发表了《中日联合宣言》。这是继《中日联合声明》、《中日和平友好条约》之后，指导两国关系发展的第三个重要文件。

　　二十世纪九十年代，中日关系继续得到发展，中日贸易和日本企业对华直接投资迅速增长。从一九九四年以来，日本成为中国最大的贸易伙伴，中国成为日本的第二大贸易伙伴。

　　1991年8月，日本首相海部俊树访华。8月12日，江泽民总书记在北京中南海会见海部俊树首相。

1992年4月6日至10日，江泽民总书记访问日本。4月6日，日本首相宫泽喜一在东京迎宾馆举行隆重仪式，欢迎江泽民总书记访日。江泽民总书记高度评价了中日邦交正常化以来两国关系的发展。

　　1992年10月24日，江泽民总书记在北京钓鱼台国宾馆会见来华访问的日本国明仁天皇。

　　1992年10月24日，江泽民总书记在北京钓鱼台国宾馆会见并宴请日本明仁天皇和皇后美智子。1992年，正值中日邦交正常化20周年之际，明仁天皇偕皇后美智子应邀于10月23日至28日对中国进行友好访问。这是日本天皇首次访问中国，受到中国政府和人民的热情欢迎。

　　1994年3月20日，江泽民主席在北京中南海会见来访的日本首相细川护熙。

　　1995年5月3日，江泽民主席在北京中南海会见来访的日本首相村山富市。

　　1997年9月5日，江泽民主席会见来访的日本首相桥本龙太郎。

　　1998年4月21日，正在日本访问的中共中央政治局常委、中国国家副主席胡锦涛与日首相桥本龙太郎在东京首相官邸会见。

　　1998年11月26日，江泽民主席和夫人王冶坪在日本皇宫同日本国明仁天皇和皇后美智子会见。天皇认为江主席的访问对两国友好关系的发展具有划时代的意义，并希望通过这次访问进一步密切两国关系。江主席说：“今年是《中日和平友好条约》缔结20周年，我愿意同贵国朝野各界在总结过去的基础上，共同探讨和构筑面向21世纪的中日友好合作关系框架。”

　　2001年10月21日，亚太经合组织第九次领导人非正式会议期间，江泽民主席在上海科技馆迎接日本首相小泉纯一郎。