1955年,军队将领阿兰布鲁发动政变,庇隆被迫流亡西班牙。阿兰布鲁政府担心劳工组织利用埃娃的遗体聚众生事,于是把遗体从总工会大楼转移,藏了起来。根据英国广播公司播出的纪录片,埃娃的遗体放置地点可能包括布宜诺斯艾利斯一条街道旁停靠的货车中、一块电影屏幕的背后以及该市地下水道系统等。而且,可以肯定的是,遗体曾被存放在军方的情报机构内。有记载称,在辗转于多个军事机构后,埃娃的遗体到了一名少校军官家中,他在自己的阁楼里用旧报纸把遗体覆盖起来。但在这名少校神秘射杀自己的妻子后,遗体不得不再度转移。
此时,劳工组织的抗议越来越激烈,他们要求看到埃娃的遗体。为避免遗体重现引发意外,当局决定将遗体送出国。1957年4月,在梵蒂冈教会人员秘密协助下,阿根廷军方把埃娃的遗体送到前往意大利的一艘船上,接着用假名将遗体下葬在米兰一处公墓。自此,“埃娃”远离阿根廷,但她从未被忘却。
1970年,一个名叫蒙特内罗的游击组织绑架并杀死了阿兰布鲁将军,因为他曾负责搬离埃娃的遗体。1971年,阿根廷再次发生政变。为换取流亡在外的庇隆支持,新上台的拉尼斯将军同意举行大选,恢复庇隆的公民权,并将埃娃的尸体交还给他。于是,埃娃的尸体被挖了出来,装到银棺中,运到庇隆和其第三任妻子伊莎贝拉在马德里的别墅。
阿根廷知名商人卡洛斯·斯帕多内是庇隆的心腹密友。1971年,他是在马德里见到埃娃遗体的首批人士之一。他回忆说:“庇隆将军、园丁和我共同将遗体从棺材中抬了出来。我们将它放在一个大理石桌子上,我们的手沾上了土,尸体也必须清洗。伊莎贝拉很细心地用棉布和水完成了这项工作。她为埃娃的遗体梳理头发,一点一点地清理,并用吹风机吹干。这花了她几天时间。”埃娃的遗体还被发现一根手指出现残缺,应该是1955年那场政变之后弄掉的,因为军官们想要确认它的确是埃娃的尸体。斯帕多内还说,尸体曾被多次击打过:“鼻子上有个大坑,脸部和胸部有被击打的痕迹,背部也有痕迹。一个膝盖有严重受损的迹象,但我不认为她的尸体像某些人说的那样曾被鞭打,我不相信。”但整体上看,尽管已经过去19年,埃娃的遗体仍然很完好。