近年来，通化市认真落实全省民营经济腾飞计划，以扩大总量、优化结构、提高质量为目标，以体制创新、科技创新和管理创新为动力，推动民营企业在创新中发展，在发展中创新，全市民营企业的活力不断增强，呈现出一派生机蓬勃的局面。

2012年，通化市民营经济实现增加值474.1亿元，占全市生产总值的53.8%，上缴税金66.3亿元，占全口径财政收入的62.5%。

从濒临破产的老国有企业到打造名牌产品“苦碟子”，拥有多家子公司的华夏集团从摆脱困境到发展壮大的过程，就是管理创新的过程。华夏集团的前身，是通化资格最老、有1000多人的制药企业大厂——通化白山制药厂。这个药厂曾经以生产青霉素、链霉素、庆大霉素等药品而全国闻名，但在激烈的市场竞争中，面临倒闭，于是政府决定启用原通化县塑料厂厂长华玉强担任厂长。华玉强上任后，首先解决的就是管理问题。

打破国有体制下的员工只进不出的管理模式，建立起员工、企业双向选择的用工制度，一次性裁员47人。裁减领导班子，实行竞聘上岗。打破级别工资制度，实行岗位工资。改造针剂车间，提升生产工艺水平，渐渐使企业走出了困境。

东宝集团，这个由2万元起家的小企业，在管理创新上，却始终走在时代的前头。第一个打破工人8级工资制，实行计件工资；第一个以集体企业兼并国有企业，先后兼并了通化县木器厂、人造板厂、食品厂、白山制药二厂等。1992年，组建了通化东宝集团，又兼并了集团所在地通化县恒德村，在国内首创“以企兼农”典型范例。1994年，集团又上台阶，成功上市，完成了企业的原始积累、资本运作和队伍壮大。为了实现让外国人用上中国药的战略目标，于2007年，又收购了通过美国FDA和欧盟EMEA双认证的瑞典瑞康生物技术有限公司，从而使东宝拥有了一个国际化的生产基地和绿色通道。

吉林万通集团，这个昔日几近破产的国有企业改制后，在董事长潘首德的带领下，历经15年的创新发展，目前已拥有三大板块产业：第一板块产业是通化万通药业股份有限公司、长春万通药业股份有限公司、梅河万通药业股份有限公司、郑州万通药业股分有限公司、郑州万通复升药业股份有限公司、河北万通金牛药业股份有限公司、万通集团药品经销公司6户医药企业；第二板块产业为万通生物工程股份有限公司、通化万通小额贷款公司、通化万通房地产股份有限公司、通化万通大酒店、中国万通俄罗斯销售公司、中国万通印尼销售公司、万通集团天露葡萄酒股份有限公司、万通集团清水丽人化妆品股份有限公司；第三板块产业为通化万通矿业集团及属下七户矿业企业。集团先后跻身全国药业百强和中国医药制造业纳税百强企业行列。荣获国家重点高新技术企业、国家火炬计划重点项目企业、国家级企业技术中心、中国优秀民营科技企业、荣获全国第十七届管理创新成果奖，全国守合同、重信用企业、全国模范劳动关系和谐企业、中国产品质量“AAAAA”级信誉企业、国家级农业产业化重点龙头企业、省市纳税状元等百余项殊荣。集团党委被授予“全国先进基层党组织”、全国非公有制企业“双强百佳党组织”、“双爱双评先进企业”光荣称号。万通商标荣获“中国驰名商标”。

多年来，通化围绕创新型城市目标，大力实施创新驱动战略，积极促进创新要素向企业集聚，使企业成为技术创新活动的主体和创新成果获益的主体，逐步形成“政府扶持创新、创新服务企业、企业自主创新、创新升级产业”的良好氛围。2012年，通化市获得吉林省首批创新型试点市，是省内唯一获此殊荣的地级城市。